Commit f4e03977 authored by Morgane Flores's avatar Morgane Flores
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# Notebook
## Session 1
### Crise de la reproductivité ?
- reproductible : si quelqu'un en atteste !
- tout consigner sur papier : naissance des publications
- permet la légitimité, pas forcément la reproductivité
- il y a toujours une perte de savoir tacite
- parfois, problème de reproductivité statistique
Pourquoi maintenant ?
- frontière entre sciences et politique : crédibilité engagée
- intégration du code
impact de l'informatique sur l'usage des statistiques
- il faut bien interpréter les résultats
- effet "boite noire" : on peut ne pas utiliser les bons modèles
## Session 2
### Exemples d'études assez controversée
Politique d'austérité
- Vient d'un paper économique contenant moult erreurs...
- Quand les données ont été partagées, le mal avait déjà été fait !
=> Importance d'avoir les données directement à disposition
Signe d'activité cérébrale d'un saumon mort?...
- Il y avait trop de bruits dans les données, ainsi même en appliquant des procédés statistiques standards, les résultats sont totalement faux.
Les erreurs sont courantes !
- programmation
- calculs
- ...
Globalement, difficulté à reproduire les résultats des papiers.
- problème méthodologique
- problème sociologique (trop de pression, il faut poster des résultats, etc)
### Pourquoi est-ce difficile ?
Manque d'information :
- sources et données
- expliquer les choix : écarter des données ? Quelle procédure statistique ?
Garder la trace de ses choix : cahier de lab !
Utilisation des ordinateurs :
- erreurs plus rapidement faite
Manque de rigueur et d'organisation
- perte de données ...
(voir les slides)
Utiliser des outils et des services ouverts
### Le document computationnel : principe
la vitrine : un document fixe, qui présente des éléments.
le document initial : dynamique, notion de session etc : notebook Jupyter
Problème de Jupyter : on ne peut pas mélanger les langages dans un même notebook
### Prise en main des outils
- Jupyter : un outil que j'utilise très régulièrement et que je maitrise bien
- RStudio : déjà utilisé mais beaucoup moins à l'aise
- OrgMode : à voir si plus utile que Jupyter dans le futur
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